El programa se divide en cinco secciones:
- Célula: donde se muestran los elementos que forman la célula. Esta pantalla se divide en dos: Célula animal y vegetal, en ellas se muestran los aspectos particulares de cada tipo celular.
- Contenidos: Permite el acceso a contenidos teóricos sobre el tema. Dentro de esta pantalla existen una serie de sub-opciones: Descripción, Metabolismo, Reproducción celular y Microscopio, que profundizan en las técnicas, elementos y procesos celulares.
- Microscopio: donde es posible estudiar muestras de células al microscopio. Las operaciones que se realizan son las mismas que se deben seguir en el Laboratorio: insertar-quitar muestra, elección de objetivos, enfoque de imagen y búsqueda de elementos.
- Simulación. Representa la pantalla principal del programa, ya que permite simular los distintos procesos celulares (Metabolismo-Mitosis y Fotosíntesis).
- Actividad: se proponen actividades para ser realizadas en un determinado tiempo, evaluando al final el resultado. No tiene como objetivo realizar una evaluación "seria" sino hacer más atractivo y entretenido el uso del programa en el proceso de aprendizaje.

Secundaria y bachillerato

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